Надо сделать 2 очень простых утилиты

1. Урезает пакетно, содержимое файлов по маске. Работает с командной строки.
например: urezalka.exe d:\files\*.* ***
В данном случае урежет все файлы в папке. Оставив 200 первых символов в каждом файле и плюс-минус 50 символов в случайном порядке.

2. Пакетно соединяет файлы, работает по маске. Работает с командной строки.
например: soedinit.exe d:\files\*.* file1.txt file2.txt original
в данном случае в каждый файл в d:\files\*.* будет добавлено содержание сначало file1.txt потом file2.txt и самого файла оригинала

пример2: soedinit.exe d:\files\*.txt file1.txt original file2.txt
в данном случае только файлы txt из папки d:\files будут обрабатоваться. сначало вставится содержимое файла file1.txt потом самого файла оригинала и потом file2.txt
все файлы сохраняются в оригинал